臺式掃描電鏡在觀察照射物體的細電子束掃描時，觀察的三維結構的表面（形狀）。一般來說，用掃描電鏡是一個單向觀察圖像，使圖像是相同的圖像平面與單眼觀察。為了得到一個三維圖像，該方法是通過傾斜的載體，從不同的角度分別獲得同等的右眼和左眼觀察觀察靜止圖像（視差圖像）和合成，所以戴上紅藍眼鏡。但這種方法需要時間，也需要調整視差圖像，所以它不能實時觀察樣品的掃描電鏡圖像。
這時發(fā)達的邊緣交換機照射試樣的電子束角和高速掃描技術，成功實現了左右視差圖像瞬時訪問。具體做法使用電磁透鏡的會聚作用，使電子束傾斜。然而，連接器電子束傾斜伴隨像差會導致較低的分辨率。這一任務發(fā)展致力于發(fā)展電子光學系統和光束掃描控制技術以及使用的技術部分。
臺式電鏡在失效分析中，除了金屬樣品外，還有很多非金屬樣品，這些樣品導電性很差。要分析這些非導電樣品，樣品的充電是不可避免的。由于電子束打到樣品上使樣品帶電，其產生的電場影響了二次電子的產生和接收，使圖像上呈現一片片亮的或暗的區(qū)域，無法進行正常觀察。要對這些非導電樣品進行分析，就必須排除樣品充電的影響。其方法之一就是將樣品上的電荷中和掉。
臺式掃描電鏡所采取的措施是：
使樣品室處于低真空狀態(tài)，樣品表面所產生的二次電子與樣品室中的氣體分子相碰撞，使氣體電離，這些氣體離子附著于樣品表面，將樣品上所帶的電荷中和掉。使用專門的探測器，接收二次電子與氣體分子相碰撞時產生的光子，這些光子也就代表了二次電子信號，使成像不受樣品導電性的影響，在分析這些樣品時能夠得到理想的成像。
臺式掃描電鏡對一些含水、含油的樣品，可以采用更低的真空度，使水分在該壓力、溫度下不至于揮發(fā)，這樣便可觀察到真實的生物樣品形貌。
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